BRENDA - Enzyme Database show
show all sequences of 5.6.2.2

A truncated form of DNA topoisomerase IIbeta associates with the mtDNA genome in mammalian mitochondria

Low, R.L.; Orton, S.; Friedman, D.B.; Eur. J. Biochem. 270, 4173-4186 (2003)

Data extracted from this reference:

Inhibitors
Inhibitors
Commentary
Organism
Structure
4'-(9-acridinylamine)methanesulfon-m-anisidide
0.003 mM, 50% inhibition
Bos taurus
Ethidium bromide
0.6 mg/l, 50% inhibition
Bos taurus
etoposide
0.07 mM, 50% inhibition
Bos taurus
NEM
0.06 mM, 50% inhibition
Bos taurus
novobiocin
0.07 mM, 50% inhibition
Bos taurus
Localization
Localization
Commentary
Organism
GeneOntology No.
Textmining
mitochondrion
the mitochondrial enzyme is a truncated version of DNA topoisomerase IIbeta
Bos taurus
5739
-
Metals/Ions
Metals/Ions
Commentary
Organism
Structure
Mg2+
maximal activity at 7.5 mM, required for relaxation of supercoiled DNA
Bos taurus
NaCl
maximal activity at 0.1 mM
Bos taurus
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight Maximum [Da]
Commentary
Organism
150000
-
glycerol gradient centrifugation
Bos taurus
Organism
Organism
Primary Accession No. (UniProt)
Commentary
Textmining
Bos taurus
-
-
-
Purification (Commentary)
Commentary
Organism
-
Bos taurus
Substrates and Products (Substrate)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
negatively supercoiled DNA + ATP + H2O
relaxation
651160
Bos taurus
?
-
651160
Bos taurus
?
topoligically relaxed plasmid DNA + ATP
catenation in presence of a DNA crowding agent
651160
Bos taurus
?
-
651160
Bos taurus
?
Subunits
Subunits
Commentary
Organism
monomer
1 * 150000, SDS-PAGE
Bos taurus
pH Optimum
pH Optimum Minimum
pH Optimum Maximum
Commentary
Organism
8
8.5
-
Bos taurus
Inhibitors (protein specific)
Inhibitors
Commentary
Organism
Structure
4'-(9-acridinylamine)methanesulfon-m-anisidide
0.003 mM, 50% inhibition
Bos taurus
Ethidium bromide
0.6 mg/l, 50% inhibition
Bos taurus
etoposide
0.07 mM, 50% inhibition
Bos taurus
NEM
0.06 mM, 50% inhibition
Bos taurus
novobiocin
0.07 mM, 50% inhibition
Bos taurus
Localization (protein specific)
Localization
Commentary
Organism
GeneOntology No.
Textmining
mitochondrion
the mitochondrial enzyme is a truncated version of DNA topoisomerase IIbeta
Bos taurus
5739
-
Metals/Ions (protein specific)
Metals/Ions
Commentary
Organism
Structure
Mg2+
maximal activity at 7.5 mM, required for relaxation of supercoiled DNA
Bos taurus
NaCl
maximal activity at 0.1 mM
Bos taurus
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight Maximum [Da]
Commentary
Organism
150000
-
glycerol gradient centrifugation
Bos taurus
Purification (Commentary) (protein specific)
Commentary
Organism
-
Bos taurus
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
negatively supercoiled DNA + ATP + H2O
relaxation
651160
Bos taurus
?
-
651160
Bos taurus
?
topoligically relaxed plasmid DNA + ATP
catenation in presence of a DNA crowding agent
651160
Bos taurus
?
-
651160
Bos taurus
?
Subunits (protein specific)
Subunits
Commentary
Organism
monomer
1 * 150000, SDS-PAGE
Bos taurus
pH Optimum (protein specific)
pH Optimum Minimum
pH Optimum Maximum
Commentary
Organism
8
8.5
-
Bos taurus
Other publictions for EC 5.6.2.2
No.
1st author
Pub Med
title
organims
journal
volume
pages
year
Activating Compound
Application
Cloned(Commentary)
Crystallization (Commentary)
Engineering
General Stability
Inhibitors
KM Value [mM]
Localization
Metals/Ions
Molecular Weight [Da]
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Organic Solvent Stability
Organism
Oxidation Stability
Posttranslational Modification
Purification (Commentary)
Reaction
Renatured (Commentary)
Source Tissue
Specific Activity [micromol/min/mg]
Storage Stability
Substrates and Products (Substrate)
Subunits
Temperature Optimum [°C]
Temperature Range [°C]
Temperature Stability [°C]
Turnover Number [1/s]
pH Optimum
pH Range
pH Stability
Cofactor
Ki Value [mM]
pI Value
IC50 Value
Activating Compound (protein specific)
Application (protein specific)
Cloned(Commentary) (protein specific)
Cofactor (protein specific)
Crystallization (Commentary) (protein specific)
Engineering (protein specific)
General Stability (protein specific)
IC50 Value (protein specific)
Inhibitors (protein specific)
Ki Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM] (protein specific)
Localization (protein specific)
Metals/Ions (protein specific)
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Organic Solvent Stability (protein specific)
Oxidation Stability (protein specific)
Posttranslational Modification (protein specific)
Purification (Commentary) (protein specific)
Renatured (Commentary) (protein specific)
Source Tissue (protein specific)
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Storage Stability (protein specific)
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Subunits (protein specific)
Temperature Optimum [°C] (protein specific)
Temperature Range [°C] (protein specific)
Temperature Stability [°C] (protein specific)
Turnover Number [1/s] (protein specific)
pH Optimum (protein specific)
pH Range (protein specific)
pH Stability (protein specific)
pI Value (protein specific)
Expression
General Information
General Information (protein specific)
Expression (protein specific)
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KCat/KM [mM/s] (protein specific)
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Nakazawa
Casein kinase II-dependent ph ...
Schizosaccharomyces pombe
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Kinetic pathways of topology ...
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Topoisomerase IIbeta and its ...
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Effect of chemical denaturant ...
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Binding and hydrolysis of a s ...
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Newly discovered chroman-2,4- ...
Rattus norvegicus
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Exploring the gyrase ATPase d ...
Mycobacterium tuberculosis, Mycobacterium tuberculosis H37Rv
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A rational design strategy of ...
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QSAR and docking studies on xa ...
Homo sapiens
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The reverse gyrase from Pyroba ...
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Insight into the cellular invo ...
Saccharolobus solfataricus, Saccharolobus solfataricus P2
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112-116
1998
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6
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1998
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Buhler
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26
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1998
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386
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J. Chromatogr.
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307-321
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Galande
Purification and functional ch ...
Rattus norvegicus
Biochim. Biophys. Acta
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58-66
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Structure-function analysis of ...
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Curr. Med. Chem.
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Hung
Characterization of topoisomer ...
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FEBS Lett.
380
127-132
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Tepe
Inhibition of DNA topoisomeras ...
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J. Med. Chem.
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Sumner
The distribution of topoisomer ...
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Jaxel
Reverse gyrase gene from Sulfo ...
Saccharolobus shibatae, Saccharolobus shibatae B12
Nucleic Acids Res.
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4668-4675
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Changes of self-association, s ...
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Expression, domain structure, ...
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Carbonera
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Purification and properties of ...
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Wells
Cell cycle phase-specific phos ...
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Froehlich-Ammon
Topoisomerase II binds to elli ...
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Nuclear distribution of Drosop ...
Drosophila melanogaster
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108
1651-1657
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Spitzner
Determination of 5' and 3' DNA ...
eukaryota
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Sakemi
CJ-12,371 and CJ-12,372, two n ...
Escherichia coli
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Benchokroun
Aurintricarboxylic acid, a put ...
Cricetulus griseus
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Flamm
In vitro evaluation of ABT-719 ...
Acinetobacter calcoaceticus, Bacteroides fragilis, Bacteroides thetaiotaomicron, Citrobacter freundii, Citrobacter spp., Clostridioides difficile, Clostridium perfringens, Corynebacterium sp., Enterococcus faecium, Enterococcus sp., Escherichia coli, Haemophilus influenzae, Klebsiella sp., Legionella sp., Listeria monocytogenes, Moraxella catarrhalis, Morganella morganii, Mycobacterium avium, Neisseria gonorrhoeae, Peptostreptococcus sp., Prevotella bivia, Proteus mirabilis, Providencia rettgeri, Providencia stuartii, Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas aeruginosa AC1679-1682, Salmonella sp., Serratia marcescens, Shigella sp., Staphylococcus aureus, Staphylococcus aureus CiproS, Staphylococcus epidermidis, Streptococcus agalactiae, Streptococcus pneumoniae, Streptococcus pyogenes, Streptococcus viridans
Antimicrob. Agents Chemother.
39
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Molecular interactions of DNA- ...
Bos taurus
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Purification of a DNA topoisom ...
Saccharolobus shibatae
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Inhibition of topoisomerase II ...
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Anticancer Res.
14
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Assairi
DNA unknotting activity (DNA t ...
Sulfolobus sp., Sulfolobus sp. B12
Biochim. Biophys. Acta
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107-114
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Shapiro
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Trypanosoma equiperdum
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14
3660-3667
1994
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Liu
Yeast topoisomerase II mutants ...
Saccharomyces cerevisiae
Cancer Res.
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2943-2951
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32
641-650
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Biochemistry
32
4862-4872
1993
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90
4753-4757
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Boege
Activation of topoisomerase II ...
Homo sapiens
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Zhang
Antitumor agents, 130, novel 4 ...
Homo sapiens
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1100-1111
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Chiatante
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DNA topoisomerase in nuclei pu ...
Pisum sativum
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A new topoisomerase-II inhibit ...
Mus musculus
J. Antibiot.
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Characterization of the intera ...
Bos taurus
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Purification of a DNA supercoi ...
eukaryota
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
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5307-5311
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Bouthier de la Tour
Reverse gyrase, a hallmark of ...
Acidianus infernus, Archaeoglobus fulgidus, Desulfurococcus saccharovorans, Methanopyrus kandleri, Methanothermus fervidus, Pyrobaculum islandicum, Pyrobaculum neutrophilum, Pyrococcus furiosus, Pyrodictium occultum, Sulfolobus acidocaldarius, Sulfolobus sp., Sulfolobus sp. B12, Thermococcus celer, Thermococcus sp., Thermococcus sp. OB9
J. Bacteriol.
172
6803-6808
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Sutcliffe
Biochemical characteristics an ...
Bacillus subtilis, Bacteria, Citrobacter freundii, Drosophila melanogaster, Escherichia coli, eukaryota, Micrococcus luteus, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Streptomyces niveus
Antimicrob. Agents Chemother.
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2027-2033
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Sullivan
Purification and characterizat ...
Cricetulus griseus
Biochemistry
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5680-5687
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Melendy
Novobiocin affinity purificati ...
Crithidia fasciculata
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Quantitation of type II topois ...
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459-468
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Reverse gyrase binding to DNA ...
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Positive supercoiling catalyse ...
Desulfurococcus amylolyticus
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395-399
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Inoue
Some properties of subunits of ...
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Inhibitors of trypanosome topo ...
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Biochem. Soc. Trans.
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Vosberg
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Topoisomerasen und Gyrasehemme ...
Bacteria, Escherichia coli
Fortschr. Antimikrob. Antiplast. Chemother.
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3811
Gellert
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Frere-Gallois
Peptide fragments of DNA topoi ...
Saccharomyces cerevisiae
Eur. J. Biochem.
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142-148
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