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show all sequences of 4.2.1.2

Purification, characterization, and immunological properties of fumarase from Euglena gracilis var. bacillaris

Shibata, H.; Gardiner, W.E.; Schwartzbach, S.D.; J. Bacteriol. 164, 762-768 (1985)

Data extracted from this reference:

Activating Compound
Activating Compound
Commentary
Organism
Structure
phosphate
at 0.1 mM malate and 5 mM phosphate: 14% increase in activity. At 0.1 mM malate and 50 mM phosphate: 60% inhibition. At 1 mM malate and 10 mM phosphate: 80% stimulation
Euglena gracilis
Inhibitors
Inhibitors
Commentary
Organism
Structure
ATP
0.35 mM, 50% inhibition
Euglena gracilis
phosphate
at 0.1 mM malate and 5 mM: 14% increase in activity. At 0.1 mM malate and 50 mM phosphate: 60% inhibition. At 1 mM malate and 10 mM phosphate: 80% stimulation
Euglena gracilis
KM Value [mM]
KM Value [mM]
KM Value Maximum [mM]
Substrate
Commentary
Organism
Structure
0.031
-
fumarate
-
Euglena gracilis
1.4
-
malate
-
Euglena gracilis
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight Maximum [Da]
Commentary
Organism
60000
-
2 * 60000, SDS-PAGE
Euglena gracilis
120000
-
gel filtration
Euglena gracilis
Organism
Organism
Primary Accession No. (UniProt)
Commentary
Textmining
Euglena gracilis
-
var. bacillaris
-
Purification (Commentary)
Commentary
Organism
-
Euglena gracilis
Source Tissue
Source Tissue
Commentary
Organism
Textmining
Specific Activity [micromol/min/mg]
Specific Activity Minimum [µmol/min/mg]
Specific Activity Maximum [µmol/min/mg]
Commentary
Organism
1047
-
-
Euglena gracilis
Substrates and Products (Substrate)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
(S)-malate
-
33751
Euglena gracilis
fumarate + H2O
-
33751
Euglena gracilis
r
Fumarate + H2O
-
33751
Euglena gracilis
L-Malate
-
33751
Euglena gracilis
r
Subunits
Subunits
Commentary
Organism
dimer
2 * 60000, SDS-PAGE
Euglena gracilis
Temperature Stability [°C]
Temperature Stability Minimum [°C]
Temperature Stability Maximum [°C]
Commentary
Organism
4
-
half-life: 4.6 h, at 0.0438 mg of protein per ml
Euglena gracilis
20
-
half-life: 1.6 h, at 0.0438 mg of protein per ml
Euglena gracilis
pH Optimum
pH Optimum Minimum
pH Optimum Maximum
Commentary
Organism
8.4
-
-
Euglena gracilis
Ki Value [mM]
Ki Value [mM]
Ki Value maximum [mM]
Inhibitor
Commentary
Organism
Structure
0.35
-
ATP
-
Euglena gracilis
Activating Compound (protein specific)
Activating Compound
Commentary
Organism
Structure
phosphate
at 0.1 mM malate and 5 mM phosphate: 14% increase in activity. At 0.1 mM malate and 50 mM phosphate: 60% inhibition. At 1 mM malate and 10 mM phosphate: 80% stimulation
Euglena gracilis
Inhibitors (protein specific)
Inhibitors
Commentary
Organism
Structure
ATP
0.35 mM, 50% inhibition
Euglena gracilis
phosphate
at 0.1 mM malate and 5 mM: 14% increase in activity. At 0.1 mM malate and 50 mM phosphate: 60% inhibition. At 1 mM malate and 10 mM phosphate: 80% stimulation
Euglena gracilis
Ki Value [mM] (protein specific)
Ki Value [mM]
Ki Value maximum [mM]
Inhibitor
Commentary
Organism
Structure
0.35
-
ATP
-
Euglena gracilis
KM Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM]
KM Value Maximum [mM]
Substrate
Commentary
Organism
Structure
0.031
-
fumarate
-
Euglena gracilis
1.4
-
malate
-
Euglena gracilis
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight Maximum [Da]
Commentary
Organism
60000
-
2 * 60000, SDS-PAGE
Euglena gracilis
120000
-
gel filtration
Euglena gracilis
Purification (Commentary) (protein specific)
Commentary
Organism
-
Euglena gracilis
Source Tissue (protein specific)
Source Tissue
Commentary
Organism
Textmining
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Specific Activity Minimum [µmol/min/mg]
Specific Activity Maximum [µmol/min/mg]
Commentary
Organism
1047
-
-
Euglena gracilis
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
(S)-malate
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33751
Euglena gracilis
fumarate + H2O
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33751
Euglena gracilis
r
Fumarate + H2O
-
33751
Euglena gracilis
L-Malate
-
33751
Euglena gracilis
r
Subunits (protein specific)
Subunits
Commentary
Organism
dimer
2 * 60000, SDS-PAGE
Euglena gracilis
Temperature Stability [°C] (protein specific)
Temperature Stability Minimum [°C]
Temperature Stability Maximum [°C]
Commentary
Organism
4
-
half-life: 4.6 h, at 0.0438 mg of protein per ml
Euglena gracilis
20
-
half-life: 1.6 h, at 0.0438 mg of protein per ml
Euglena gracilis
pH Optimum (protein specific)
pH Optimum Minimum
pH Optimum Maximum
Commentary
Organism
8.4
-
-
Euglena gracilis
Other publictions for EC 4.2.1.2
No.
1st author
Pub Med
title
organims
journal
volume
pages
year
Activating Compound
Application
Cloned(Commentary)
Crystallization (Commentary)
Engineering
General Stability
Inhibitors
KM Value [mM]
Localization
Metals/Ions
Molecular Weight [Da]
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Organic Solvent Stability
Organism
Oxidation Stability
Posttranslational Modification
Purification (Commentary)
Reaction
Renatured (Commentary)
Source Tissue
Specific Activity [micromol/min/mg]
Storage Stability
Substrates and Products (Substrate)
Subunits
Temperature Optimum [°C]
Temperature Range [°C]
Temperature Stability [°C]
Turnover Number [1/s]
pH Optimum
pH Range
pH Stability
Cofactor
Ki Value [mM]
pI Value
IC50 Value
Activating Compound (protein specific)
Application (protein specific)
Cloned(Commentary) (protein specific)
Cofactor (protein specific)
Crystallization (Commentary) (protein specific)
Engineering (protein specific)
General Stability (protein specific)
IC50 Value (protein specific)
Inhibitors (protein specific)
Ki Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM] (protein specific)
Localization (protein specific)
Metals/Ions (protein specific)
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Organic Solvent Stability (protein specific)
Oxidation Stability (protein specific)
Posttranslational Modification (protein specific)
Purification (Commentary) (protein specific)
Renatured (Commentary) (protein specific)
Source Tissue (protein specific)
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Storage Stability (protein specific)
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Subunits (protein specific)
Temperature Optimum [°C] (protein specific)
Temperature Range [°C] (protein specific)
Temperature Stability [°C] (protein specific)
Turnover Number [1/s] (protein specific)
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pH Range (protein specific)
pH Stability (protein specific)
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Expression
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KCat/KM [mM/s] (protein specific)
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Lin
Enhancing the thermostability ...
Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium glutamicum DSM 20300
Enzyme Microb. Technol.
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Zubimendi
The complex allosteric and re ...
Arabidopsis thaliana
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Bulku
Biochemical characterization ...
Homo sapiens
Open Biochem. J.
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Expression and properties of ...
Helianthus annuus
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Singer
Bacterial fumarase and L-mali ...
Bacillus subtilis
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Usa
Elevation of fumarase attenua ...
Rattus norvegicus
Physiol. Genomics
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Fumarase activity an in vivo ...
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Sci. Rep.
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40812
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Dyson
FUM2, a cytosolic fumarase, i ...
Arabidopsis thaliana
Plant Physiol.
172
118-127
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Light inhibition of fumarase ...
Arabidopsis thaliana
Plant Physiol. Biochem.
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Fumarate production by Torulo ...
Rhizopus oryzae, Rhizopus oryzae ATCC 10260
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Thermus thermophilus
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Kronen
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Identification of a novel fuma ...
Streptomyces lividans
Mol. Biol. Rep.
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Cloning, expression, purifica ...
Homo sapiens
Acta Crystallogr. Sect. F
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Biochemical similarities and d ...
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Molecular characterization of ...
Solanum tuberosum
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Daneel
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Tosa
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Colombo
Molecular cloning, nucleotide ...
Saccharolobus solfataricus, Saccharolobus solfataricus MT-4 / DSM 5833
FEBS Lett.
337
93-98
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Purification and crystallizati ...
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Keruchenko
Purification, characterization ...
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85-92
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Flint
Fumarase a from Escherichia co ...
Escherichia coli
Biochemistry
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10331-10337
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Ueda
Purification and characterizat ...
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Puchegger
Purification and properties of ...
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J. Gen. Microbiol.
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Yumoto
Characterization of multiple f ...
Escherichia coli
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Two biochemically distinct cla ...
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Beeckmans
A new purification procedure f ...
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Cook
Purification and catalytic pro ...
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Kanarek
The preparation and characteri ...
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Azotobacter vinelandii, Saccharomyces cerevisiae, Sus scrofa
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