BRENDA - Enzyme Database
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Conformational change of adenosine deaminase during ligand-exchange in a crystal

Kinoshita, T.; Tada, T.; Nakanishi, I.; Biochem. Biophys. Res. Commun. 373, 53-57 (2008)

Data extracted from this reference:

Crystallization (Commentary)
Crystallization
Organism
crystal structure of adenosine deaminase ligated with (+)-erythro-9-(2-hydroxy-3-nonyl)adenine (EHNA), vapor diffusion, sitting drop, 2 M ammonium sulfate, 2% 2-methyl-2, 4-pentanediol, 0.1 M MES buffer, pH 6.0, temperature 293K, , X-ray diffraction structure determination and analysis at 2.52 A resolution, space group P 43 21 2, EHNA induces conformational change of adenosine deaminase to the open form in the crystalline state, structural comparison between the EHNA-ADA complex and the 1-eaza-adenosine-ADA complex
Bos taurus
Inhibitors
Inhibitors
Commentary
Organism
Structure
erythro-9-(2-hydroxy-3-nonyl)adenine hydrochloride
-
Bos taurus
Organism
Organism
Primary Accession No. (UniProt)
Commentary
Textmining
Bos taurus
P56658
-
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Purification (Commentary)
Commentary
Organism
-
Bos taurus
Source Tissue
Source Tissue
Commentary
Organism
Textmining
intestine
-
Bos taurus
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Crystallization (Commentary) (protein specific)
Crystallization
Organism
crystal structure of adenosine deaminase ligated with (+)-erythro-9-(2-hydroxy-3-nonyl)adenine (EHNA), vapor diffusion, sitting drop, 2 M ammonium sulfate, 2% 2-methyl-2, 4-pentanediol, 0.1 M MES buffer, pH 6.0, temperature 293K, , X-ray diffraction structure determination and analysis at 2.52 A resolution, space group P 43 21 2, EHNA induces conformational change of adenosine deaminase to the open form in the crystalline state, structural comparison between the EHNA-ADA complex and the 1-eaza-adenosine-ADA complex
Bos taurus
Inhibitors (protein specific)
Inhibitors
Commentary
Organism
Structure
erythro-9-(2-hydroxy-3-nonyl)adenine hydrochloride
-
Bos taurus
Purification (Commentary) (protein specific)
Commentary
Organism
-
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Source Tissue (protein specific)
Source Tissue
Commentary
Organism
Textmining
intestine
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Bos taurus
-
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No.
1st author
Pub Med
title
organims
journal
volume
pages
year
Activating Compound
Application
Cloned(Commentary)
Crystallization (Commentary)
Engineering
General Stability
Inhibitors
KM Value [mM]
Localization
Metals/Ions
Molecular Weight [Da]
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Organic Solvent Stability
Organism
Oxidation Stability
Posttranslational Modification
Purification (Commentary)
Reaction
Renatured (Commentary)
Source Tissue
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Subunits
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Temperature Stability [°C]
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pH Range
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Application (protein specific)
Cloned(Commentary) (protein specific)
Cofactor (protein specific)
Crystallization (Commentary) (protein specific)
Engineering (protein specific)
General Stability (protein specific)
IC50 Value (protein specific)
Inhibitors (protein specific)
Ki Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM] (protein specific)
Localization (protein specific)
Metals/Ions (protein specific)
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Organic Solvent Stability (protein specific)
Oxidation Stability (protein specific)
Posttranslational Modification (protein specific)
Purification (Commentary) (protein specific)
Renatured (Commentary) (protein specific)
Source Tissue (protein specific)
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Storage Stability (protein specific)
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Subunits (protein specific)
Temperature Optimum [°C] (protein specific)
Temperature Range [°C] (protein specific)
Temperature Stability [°C] (protein specific)
Turnover Number [1/s] (protein specific)
pH Optimum (protein specific)
pH Range (protein specific)
pH Stability (protein specific)
pI Value (protein specific)
Expression
General Information
General Information (protein specific)
Expression (protein specific)
KCat/KM [mM/s]
KCat/KM [mM/s] (protein specific)
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Lougiakis
Synthesis of new nebularine an ...
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Cancer Biother. Radiopharm.
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Identification of a 5'-deoxyad ...
Methanocaldococcus jannaschii, Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661
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Reverse carbocyclic fleximers: ...
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Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids
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Development of a rapid, microp ...
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Clin. Chim. Acta
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Structure of bovine adenosine ...
Bos taurus
Acta Crystallogr. Sect. D
59
299-303
2003
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654788
Mardanyan
Interaction of adenosine deami ...
Bos taurus
Biochemistry (Moscow)
67
770-777
2002
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654832
Ben-Shooshan
On the regulatory role of dipe ...
Bos taurus
Biochim. Biophys. Acta
1587
21-30
2002
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655265
Iwaki-Egawa
Characterization and purificat ...
Gallus gallus, Homo sapiens
Comp. Biochem. Physiol. B
133
173-182
2002
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655734
Alrokayan
Purification and characterizat ...
Camelus dromedarius
Int. J. Biochem. Cell Biol.
34
1608-1618
2002
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656375
Castro
Binding thermodynamics of the ...
Bos taurus
J. Enzyme Inhib.
16
217-232
2001
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209637
Singh
Purification and characterizat ...
Mus musculus
Mol. Cell. Biochem.
204
127-134
2000
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209635
Kinoshita
Crystallization and preliminar ...
Bos taurus
Acta Crystallogr. Sect. D
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2031-2032
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209636
Challa
Properties of adenosine deamin ...
Candida albicans
J. Basic Microbiol.
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209633
Lupidi
Inhibition studies on membrane ...
Homo sapiens
Biochem. Mol. Biol. Int.
46
1071-1080
1998
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734059
Stuer-Lauridsen
Purine salvage in two halophil ...
Halobacterium salinarum, Haloferax volcanii
J. Bacteriol.
180
457-463
1998
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209629
Hough
Purification of the Xenopus la ...
Xenopus laevis
J. Biol. Chem.
269
9933-9939
1994
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Jun
Purification and charaterizati ...
Nocardioides sp., Nocardioides sp. J-326TK
Biotechnol. Appl. Biochem.
20
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Abu-Shady
Properties of adenosine deamin ...
Aspergillus terricola
Acta Microbiol. Pol.
43
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Jun
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Purification and characterizat ...
Streptomyces sp., Streptomyces sp. J-845S
J. Ferment. Bioeng.
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Ling
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Purification and characterizat ...
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J. Ferment. Bioeng.
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209625
Centelles
Slight differences between ade ...
Homo sapiens, Rattus norvegicus
Arch. Int. Physiol. Biochim.
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Schrader
Characterization of the adenos ...
Cavia porcellus, Homo sapiens, Mus musculus, Oryctolagus cuniculus, Platyrrhini
J. Biol. Chem.
265
19312-19318
1990
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Philips
Immunoaffinity purification an ...
Homo sapiens
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26
2893-2903
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Gabellieri
Purification, stability and ki ...
Bacillus cereus
Biochim. Biophys. Acta
884
490-496
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Human malaria parasite adenosi ...
Homo sapiens, Plasmodium falciparum
J. Biol. Chem.
259
1472-1475
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Jaroszewicz
Adenosine deaminase from pig t ...
Sus scrofa
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138-145
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Hunt
Adenosine deaminase from deoxy ...
Rattus norvegicus
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Tsukada
Adenosine deaminase from Azoto ...
Azotobacter vinelandii 0, Azotobacter vinelandii
Arch. Microbiol.
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Purification and crystallizati ...
Pseudomonas iodinum
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1973
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209605
Akedo
Multiple forms of human adenos ...
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Biochim. Biophys. Acta
276
257-271
1972
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209604
Sim
Studies on adenosine deaminase ...
Bos taurus
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23
17-21
1971
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