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show all sequences of 2.6.1.1

Functional and structural analysis of cis-proline mutants of Escherichia coli aspartate aminotransferase

Birolo, L.; Malashkevich, V.N.; Capitani, G.; De Luca, F.; Moretta, A.; Jansonius, J.N.; Marino, G.; Biochemistry 38, 905-913 (1999)

Data extracted from this reference:

Crystallization (Commentary)
Crystallization
Organism
hanging drop vapour diffusion, crystals of mutants P195A and P138A/P195A in complex with maleate, protein solution: 20 mg/ml, 10 mM potassium phosphate, 0.01 mM pyridoxal 5'-phosphate, 2 mM EDTA, 0.5 mM DTT, reservoir solution: 1.9-2.1 M ammonium sulfate, 0.2 M 2-methylmorpholine, 2% polyethylene glycol 400, mutant P138A/P195A is also crystallized in complex with maleate, 20 mM, X-ray diffraction structure analysis
Escherichia coli
Engineering
Amino acid exchange
Commentary
Organism
P138A
oligonucleotide-directed mutagenesis, no significant effect, unaltered compared to the wild-type
Escherichia coli
P138A/P195A
oligonucleotide-directed mutagenesis
Escherichia coli
P195A
oligonucleotide-directed mutagenesis, no significant effect, unaltered compared to the wild-type
Escherichia coli
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Natural Substrates
Organism
Commentary (Nat. Sub.)
Natural Products
Commentary (Nat. Pro.)
Organism (Nat. Pro.)
Reversibility
L-aspartate + 2-oxoglutarate
Escherichia coli
-
oxaloacetate + L-glutamate
-
Escherichia coli
?
Organism
Organism
Primary Accession No. (UniProt)
Commentary
Textmining
Escherichia coli
P00509
-
-
Renatured (Commentary)
Commentary
Organism
wild-type and mutants, unfolding by guanidinium hydrochloride and renaturing kinetics, fluorescent spectrometric analysis
Escherichia coli
Specific Activity [micromol/min/mg]
Specific Activity Minimum [µmol/min/mg]
Specific Activity Maximum [µmol/min/mg]
Commentary
Organism
additional information
-
-
Escherichia coli
Substrates and Products (Substrate)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
L-aspartate + 2-oxoglutarate
-
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Escherichia coli
oxaloacetate + L-glutamate
-
639879
Escherichia coli
?
L-aspartate + 2-oxoglutarate
-
639879
Escherichia coli
oxaloacetate + L-glutamate
-
639879
Escherichia coli
r
Temperature Optimum [°C]
Temperature Optimum [°C]
Temperature Optimum Maximum [°C]
Commentary
Organism
25
-
assay at
Escherichia coli
pH Optimum
pH Optimum Minimum
pH Optimum Maximum
Commentary
Organism
8
-
assay at
Escherichia coli
Crystallization (Commentary) (protein specific)
Crystallization
Organism
hanging drop vapour diffusion, crystals of mutants P195A and P138A/P195A in complex with maleate, protein solution: 20 mg/ml, 10 mM potassium phosphate, 0.01 mM pyridoxal 5'-phosphate, 2 mM EDTA, 0.5 mM DTT, reservoir solution: 1.9-2.1 M ammonium sulfate, 0.2 M 2-methylmorpholine, 2% polyethylene glycol 400, mutant P138A/P195A is also crystallized in complex with maleate, 20 mM, X-ray diffraction structure analysis
Escherichia coli
Engineering (protein specific)
Amino acid exchange
Commentary
Organism
P138A
oligonucleotide-directed mutagenesis, no significant effect, unaltered compared to the wild-type
Escherichia coli
P138A/P195A
oligonucleotide-directed mutagenesis
Escherichia coli
P195A
oligonucleotide-directed mutagenesis, no significant effect, unaltered compared to the wild-type
Escherichia coli
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Natural Substrates
Organism
Commentary (Nat. Sub.)
Natural Products
Commentary (Nat. Pro.)
Organism (Nat. Pro.)
Reversibility
L-aspartate + 2-oxoglutarate
Escherichia coli
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oxaloacetate + L-glutamate
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Escherichia coli
?
Renatured (Commentary) (protein specific)
Commentary
Organism
wild-type and mutants, unfolding by guanidinium hydrochloride and renaturing kinetics, fluorescent spectrometric analysis
Escherichia coli
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Specific Activity Minimum [µmol/min/mg]
Specific Activity Maximum [µmol/min/mg]
Commentary
Organism
additional information
-
-
Escherichia coli
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
L-aspartate + 2-oxoglutarate
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Escherichia coli
oxaloacetate + L-glutamate
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Escherichia coli
?
L-aspartate + 2-oxoglutarate
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Escherichia coli
oxaloacetate + L-glutamate
-
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Escherichia coli
r
Temperature Optimum [°C] (protein specific)
Temperature Optimum [°C]
Temperature Optimum Maximum [°C]
Commentary
Organism
25
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assay at
Escherichia coli
pH Optimum (protein specific)
pH Optimum Minimum
pH Optimum Maximum
Commentary
Organism
8
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assay at
Escherichia coli
Other publictions for EC 2.6.1.1
No.
1st author
Pub Med
title
organims
journal
volume
pages
year
Activating Compound
Application
Cloned(Commentary)
Crystallization (Commentary)
Engineering
General Stability
Inhibitors
KM Value [mM]
Localization
Metals/Ions
Molecular Weight [Da]
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Organic Solvent Stability
Organism
Oxidation Stability
Posttranslational Modification
Purification (Commentary)
Reaction
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Source Tissue
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Storage Stability
Substrates and Products (Substrate)
Subunits
Temperature Optimum [°C]
Temperature Range [°C]
Temperature Stability [°C]
Turnover Number [1/s]
pH Optimum
pH Range
pH Stability
Cofactor
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pI Value
IC50 Value
Activating Compound (protein specific)
Application (protein specific)
Cloned(Commentary) (protein specific)
Cofactor (protein specific)
Crystallization (Commentary) (protein specific)
Engineering (protein specific)
General Stability (protein specific)
IC50 Value (protein specific)
Inhibitors (protein specific)
Ki Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM] (protein specific)
Localization (protein specific)
Metals/Ions (protein specific)
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Organic Solvent Stability (protein specific)
Oxidation Stability (protein specific)
Posttranslational Modification (protein specific)
Purification (Commentary) (protein specific)
Renatured (Commentary) (protein specific)
Source Tissue (protein specific)
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Storage Stability (protein specific)
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Subunits (protein specific)
Temperature Optimum [°C] (protein specific)
Temperature Range [°C] (protein specific)
Temperature Stability [°C] (protein specific)
Turnover Number [1/s] (protein specific)
pH Optimum (protein specific)
pH Range (protein specific)
pH Stability (protein specific)
pI Value (protein specific)
Expression
General Information
General Information (protein specific)
Expression (protein specific)
KCat/KM [mM/s]
KCat/KM [mM/s] (protein specific)
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Luo
Cosynthesis of l-homophenylala ...
Escherichia coli, Escherichia coli BL21-DE3
J. Biosci. Bioeng.
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Wang
PsAAT3, an oomycete-specific a ...
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Fungal Biol.
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Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium glutamicum ATCC 13032
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e0158402
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Structures of aspartate aminot ...
Giardia intestinalis, Giardia intestinalis ATCC 50803, Leishmania major, Trypanosoma brucei brucei, Trypanosoma brucei brucei 927 / 4 GUTat10.1 / TREU927
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Genetically modifying aspartat ...
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Three different classes of ami ...
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Katayama
Possible role of cysteine-S-co ...
Mus musculus, Oryctolagus cuniculus, Rattus norvegicus
Food Chem. Toxicol.
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Rattus norvegicus
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Circulating osteocalcin concen ...
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Analysis of aspartate aminotra ...
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Observations of alanine aminot ...
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Identification and functional ...
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639876
Wilkie
Recombinant expression, purifi ...
Arabidopsis thaliana
Protein Expr. Purif.
12
381-389
1998
-
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639886
Artigues
Divergent Hsc70 binding proper ...
Rattus norvegicus
J. Biol. Chem.
273
33130-33134
1998
1
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682626
Arnone
Stability of aspartate aminotr ...
Saccharolobus solfataricus
Protein Eng.
10
237-248
1997
-
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Okamoto
An aspartate aminotransferase ...
Thermus thermophilus, Thermus thermophilus HB8 / ATCC 27634 / DSM 579
J. Biochem.
119
135-144
1996
-
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639872
Kato
Irreversible inactivation of a ...
Mus musculus, Rattus norvegicus, Sus scrofa
J. Biochem.
120
531-539
1996
-
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639866
Zhou
Mitochondrial aspartate aminot ...
Rattus norvegicus
Proc. Soc. Exp. Biol. Med.
208
263-270
1995
-
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639867
Taniguchi
Aspartate aminotransferase iso ...
Panicum miliaceum
Arch. Biochem. Biophys.
318
295-306
1995
-
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639868
Okada
Effects of aminoguanidine and ...
Rattus norvegicus
J. Nutr. Sci. Vitaminol.
41
43-50
1995
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639869
Vessal
Partial purification and kinet ...
Homo sapiens
Comp. Biochem. Physiol. B
110
431-437
1995
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639870
Hayashi
Reaction of aspartate aminotra ...
Escherichia coli
Biochemistry
34
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1995
-
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639820
Muriana
-
Further thermal characterizati ...
Haloferax mediterranei, Haloferax mediterranei R-4 / ATCC 33500
Biochem. J.
298
465-470
1994
-
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679622
Zappacosta
Post-translational modificatio ...
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Eur. J. Biochem.
222
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1994
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639818
Yagi
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Purification and characterizat ...
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57
2074-2080
1993
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639819
Yagi
-
Distribution and cellular loca ...
Oryza sativa
Biosci. Biotechnol. Biochem.
57
2081-2084
1993
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724610
Cubellis
Comparative studies on thermop ...
Saccharolobus solfataricus
Biotechnol. Appl. Biochem.
18
417-425
1993
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639845
Tanaka
Further studies on aspartate a ...
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112
811-815
1992
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679619
Arnone
Limited proteolysis as a probe ...
Saccharolobus solfataricus
Eur. J. Biochem.
204
1183-1189
1992
-
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724405
Arnone
Expression of a hyperthermophi ...
Saccharolobus solfataricus, Saccharolobus solfataricus MT-4 / DSM 5833
Biochim. Biophys. Acta
1160
206-212
1992
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639840
Malashkevich
New crystal form of cytosolic ...
Gallus gallus
J. Mol. Biol.
221
61-63
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639854
Turano
Rapid purification and thermos ...
Daucus carota
Plant Physiol.
97
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639856
Quiroga
Comparison of some of the prop ...
Gallus gallus
Biochem. Soc. Trans.
19
74S
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639861
Muriana
-
Purification and characterizat ...
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Biochem. J.
278
149-154
1991
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678364
Birolo
The active site of Sulfolobus ...
Saccharolobus solfataricus
Biochim. Biophys. Acta
1080
198-204
1991
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639839
Izard
Trigonal crystals of porcine m ...
Sus scrofa
J. Mol. Biol.
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341-344
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Herold
Reversible dissociation and un ...
Escherichia coli
Biochemistry
29
1907-1913
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Yagi
Distribution of aspartate amin ...
Cystobasidium minutum, Torulopsis candida
J. Biochem.
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639848
Taniguchi
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Eleusine coracana
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-
639849
Sung
Purification and characterizat ...
Bacillus sp. (in: Bacteria), Bacillus sp. (in: Bacteria) YM-2
J. Bacteriol.
172
1345-1351
1990
-
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2
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2
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1
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-
639859
Lain-Guelbenzu
Purification and properties of ...
Chlamydomonas reinhardtii, Chlamydomonas reinhardtii 6145c
Eur. J. Biochem.
188
529-533
1990
-
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3
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-
639860
Tanaka
-
Purification and some properti ...
Methanothermobacter thermautotrophicus, Methanothermobacter thermautotrophicus SF-4
Agric. Biol. Chem.
54
625-631
1990
-
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-
-
-
639833
Romestant
Aspartate aminotransferase iso ...
Leptosphaeria michotii
Eur. J. Biochem.
180
153-159
1989
-
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-
639835
Numazawa
Aspartate aminotransferase fro ...
Megathyrsus maximus
Arch. Biochem. Biophys.
270
313-319
1989
-
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-
639841
Smith
2.8-A-resolution crystal struc ...
Escherichia coli
Biochemistry
28
8161-8167
1989
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639843
Jäger
Crystallization and preliminar ...
Escherichia coli
J. Mol. Biol.
209
499-501
1989
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-
639858
Griffith
Aspartate aminotransferase in ...
Medicago sativa
Plant Physiol.
90
1622-1629
1989
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-
679614
Cubellis
Cloning and sequencing of the ...
Saccharolobus solfataricus, Saccharolobus solfataricus MT4
Eur. J. Biochem.
186
375-381
1989
-
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-
639837
Marino
Purification and characterizat ...
Saccharolobus solfataricus
J. Biol. Chem.
263
12305-12309
1988
-
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-
639823
Kamitori
Overproduction and preliminary ...
Escherichia coli
J. Biochem.
101
813-816
1987
-
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-
639844
Fotheringham
-
The cloning ans sequence analy ...
Escherichia coli
Biochem. J.
234
592-604
1986
-
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Lowe
Aspartate: 2-oxoglutarate amin ...
Trichomonas vaginalis, Trichomonas vaginalis Bushby
Biochem. J.
232
689-695
1985
-
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639815
Yagi
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Escherichia coli, Escherichia coli B / ATCC 11303
Methods Enzymol.
113
83-89
1985
-
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639828
Kuramitsu
Aspartate aminotransferase iso ...
Oryctolagus cuniculus
J. Biochem.
97
1337-1345
1985
-
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-
286649
Potvin
-
Thermal properties of NAD mala ...
Arabidopsis thaliana
Plant Sci. Lett.
31
35-47
1983
-
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-
639864
Yagi
Aspartate: 2-oxoglutarate amin ...
Saccharomyces cerevisiae
J. Biochem.
92
35-43
1982
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-
-
-
639863
Reynolds
Enzymes of nitrogen metabolism ...
Lupinus angustifolius
Arch. Biochem. Biophys.
209
524-533
1981
-
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-
636718
Eze
-
Some properties of aspartate a ...
Trichoderma viride
J. Gen. Microbiol.
120
523-527
1980
-
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639829
Recasens
Cysteine sulfinate aminotransf ...
Rattus norvegicus
Biochemistry
19
4583-4589
1980
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-
639831
Barra
The cytosolic and mitochondria ...
Sus scrofa
Eur. J. Biochem.
108
405-414
1980
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639817
Metzler
Investigation of crystalline e ...
Sus scrofa
Methods Enzymol.
62
551-558
1979
-
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-
639821
Mozzarelli
Catalytic activity of aspartat ...
Sus scrofa
Eur. J. Biochem.
98
173-179
1979
-
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639822
Eichele
Crystallization of pig mitocho ...
Gallus gallus, Sus scrofa
J. Mol. Biol.
135
513-516
1979
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639834
Capasso
Mitochondrial bovine aspartate ...
Bos taurus
FEBS Lett.
101
351-354
1979
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639836
Orlacchio
Some kinetic and other propert ...
Ovis aries
Biochem. J.
177
583-593
1979
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639855
Yagi
Crystallization and properties ...
Escherichia coli, Escherichia coli B / ATCC 11303
FEBS Lett.
100
81-84
1979
-
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Ryan
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Purification and characterizat ...
Bradyrhizobium japonicum, Bradyrhizobium japonicum 392, Glycine max
Phytochemistry
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Aoki
Crystallization and immunologi ...
Canis lupus familiaris
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